In unserem Labor

DNA-Analyse

Das Testverfahren beginnt, sobald Ihre Speichelprobe in unserem Labor ankommt. Diesen Satz weglassen, da inhaltlich Dopplung mit dem nächsten. Ihre Probe wird an unsere erfahrenen DNA-Techniker zur DNA-Isolierung, -Amplifikation und -Detektion weitergegeben.

 

Während der Nachweisreaktion extrahieren wir die Informationen, die in Ihren Genen stecken. Der letzte Schritt ist die Interpretation der Daten der DNA-Sequenz, wobei unsere hochqualifizierten DNA-Experten von ihrer jahrzehntelangen DNA-Forschung bei weltweit führenden Institutionen profitieren.

 

Unter Verwendung der neuesten Entwicklungen auf dem Gebiet der Bioinformatik stellen unsere DNA-Experten einen ausführlichen Bericht zusammen, der das Vorhandensein von SNPs und möglichen Krankheitsrisiken aufzeigt.

PCR und DNA Fragmentierung

Die DNA-Menge in der ursprünglichen Probe ist sehr gering, sodass die Probe vervielfältigt werden muss, um genügend Material für den APEX-Nachweis bereitzustellen. Diese Vervielfältigung geschieht während einer chemischen Reaktion, die PCR (Polymerasekettenreaktion) genannt wird. Während der PCR wird jedes DNA-Molekül mehrere Male kopiert wird, wodurch von jedem Molekül Milliarden von Kopien entstehen.

 

Nur ausgewählte DNA-Bereiche, die möglicherweise SNPs enthalten und mit bestimmten Krankheiten in Zusammenhang stehen, werden vervielfältigt, um die Zeit und die Reagenzien, die für diese Reaktion verwendet werden, zu minimieren. DNA-Moleküle sind sehr lang; zur leichteren Handhabung werden sie nach der Vervielfältigung in kleinere Teile fragmentiert.

APEX-Reaktion

Der nächste Schritt ist entscheidend für den erfolgreichen Nachweis von SNPs. Dabei wird die fragmentierte DNA-Mischung auf einen Chip transferiert, auf dem kurze Einzelstrang-DNA-Moleküle - genannt Primer - chemisch angebracht sind. Eine Reaktionsmischung enthält sowohl Nukleotide für die DNA-Synthese als auch die vier DNA-Terminator-Nukleotide, wobei jedes mit seiner eigenen Farbe mittels eines Fluoreszenzfarbstoff markiert ist.

 

Wenn ein Terminator-Nukleotid in ein DNA-Molekül eingebaut wird, hört die Synthese dieses bestimmten Moleküls auf. Am Ende dieser Reaktion haben wir eine Reihe von DNA-Fragmenten in unterschiedlicher Größe, jedes ist mit einer eindeutigen Farbe markiert. Diese Reaktion wird sorgfältig optimiert, um den höchsten Signal/Rausch-Abstand zu erhalten und um die Spezifität des Nachweises zu gewährleisten.

APEX Nachweis

Für den SNP-Nachweis werden die Chips mit den fluoreszierenden DNA-Reihen in einem Quattrolmager visualisiert - einem Gerät, das mit vier Lasern und einer hochempfindlichen Spezialkamera ausgestattet ist. Die fluoreszierenden Farbmuster werden aufgenommen und dann von der Genorama Genotyping Software analysiert, die die Bildinformation in DNA-Sequenzdaten umwandelt. Diese Sequenzdaten werden dann zum SNP-Nachweis verwendet.

Datenanalyse und Interpretation

In Zusammenarbeit mit Bioinformatikern verwendet der DNA-Experte die DNA-Sequenzdaten zum Nachweis von SNPs in den DNA-Regionen, welche mit Krankheiten assoziiert sind. Der DNA-Experte vergleicht diese Daten mit Vorkenntnissen und berechnet anschließend das Risiko, an einer bestimmten Krankheit zu erkranken. Eine detaillierte Analyse, die die Sequenzinformationen und das Vorhandensein von SNPs enthält, wird an den Kunden übermittelt.

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